Test génétique : Le polymorphisme FUT2 (rs601338)

Physiologie :

La fucosyltransférase 2 (FUT2) est un gène codant pour une enzyme appelée galactoside 2-alpha-L- fucosyltransférase 2.

Cette enzyme transfère le monosaccharide L-fucose sur des chaînes oligosaccharidiques pour former des glycans fucosylés. L’activité de cette enzyme est indispensable pour la sécrétion de ces glycans au niveau des muqueuses notamment celles du tube digestif où ils jouent un rôle important pour la santé. Ces glycans sont également secrétés dans le lait maternel et interviennent dans le développement d’un microbiote eubiotique chez le nouveau-né. Ils favorisent notamment les bifidobactéries.

Il existe des variants polymorphogéniques du gène FUT2 dans la population humaine qui se caractérisent par la substitution d’un seul nucléotide par un autre (SNP : Single nucleotide polymorphysm), G428A (G remplacé par A en position 428) ou A385T (A remplacée par un T en position 385). Ces modifications ont pour conséquence la perte de l’activité de l’enzyme qui entraine la non-sécrétion des glycans fucosylés avec des conséquences importantes pour la santé.

Quels résultats ?

• Le polymorphisme rs601338 correspond à la mutation G461A (l’allèle A est le variant non‑sécréteur).

Génotype GA (sécréteur, heterozygote sauvage)

Elle exprime l’antigène ABO dans les sécrétions (salive, muqueuses intestinales…).

• Contrairement aux non‑sécréteurs (AA), elle n’a pas de résistance naturelle aux norovirus/rotavirus, mais elle présente moins de risque de dysbiose, de maladie de Crohn, de diabète de type 1, et une meilleure tolérance au gluten (en partie grâce à une flore bifidobactérienne plus diversifiée).

• Elle peut avoir des taux de vitamine B12 intermédiaires (sans gravité, mais à surveiller si carence).

Génotype GG (sécréteur, homozygote sauvage)

• Expression normale de l’antigène ABO dans les sécrétions (salive, muqueuses intestinales, etc.).

• Avantages :

  • Flore intestinale diversifiée avec une bonne proportion de bifidobactéries.

  • Meilleure tolérance au gluten (aide à la digestion via le microbiote).

  • Risque plus faible de maladie de Crohn, de diabète de type 1, de cholangite sclérosante primitive.

  • Pas de déficit en vitamine B12 lié à ce gène (taux habituellement dans les normes).

• Inconvénients :

  • Pas de résistance naturelle aux infections à norovirus ou rotavirus (sensibilité normale).

  • Risque de diarrhée infectieuse légèrement plus élevé chez les enfants de mères sécrétrices (données épidémiologiques).

• Recommandation : pas de précaution particulière, mais une bonne hygiène alimentaire reste importante.

Génotype AA (non‑sécréteur, homozygote variant)

• Absence d’expression de l’antigène ABO dans les sécrétions.

• Avantages :

  • Résistance naturelle aux infections à norovirus et rotavirus (moindre sensibilité).

  • Taux de vitamine B12 souvent plus élevés dans le sérum (attention : peut masquer une carence fonctionnelle).

• Inconvénients :

  • Risque accru de dysbiose intestinale (déséquilibre du microbiote), avec une moindre proportion de bifidobactéries.

  • Certaines études suggèrent des associations, encore discutées de prédisposition aux maladies associées : infection à Helicobacter pylori, maladie de Crohn, colite ulcéreuse, diabète de type 1.

  • Moins bonne tolérance au gluten (risque de symptômes liés au gluten même en l’absence de maladie cœliaque).

• Recommandation :

  • Surveillance du microbiote (tests fonctionnels) et soutien probiotique (bifidobactéries) si besoin.

  • Dosage de la vitamine B12 associé à l’acide méthylmalonique pour évaluer la véritable carence (le taux sérique peut être faussement rassurant).

  • En cas de symptômes digestifs, évaluation de la sensibilité au gluten.

Les individus qui ont hérité de deux gènes FUT2 fonctionnels (homozygote) ou d’un fonctionnel et l’autre non (hétérozygotes) sécrètent les glycans fucosylés et sont désignés sécréteurs. Ceux qui ont les deux gènes FUT2 inactifs (homozygotes récessifs), sont non sécréteurs. Cette dernière catégorie représente 20% de la population. L’absence de glycans fucosylés dans le mucus entraine des perturbations du microbiote avec notamment une diminution significative de la population des bifidobactéries.

Si vous avez hérité de deux gènes qui tous les deux portent au moins une séquence qui correspond à la galactoside 2-alpha-L-fucosyltransférase 2 inactive, vous êtes considéré comme non sécréteur. L’absence de glycans fucosylés touche 20 % de la population humaine. Les individus non sécréteurs ont plus de risque souffrir de dysbiose mais aussi de développer un diabète de type 1, des maladies auto-immunes de l’intestin (maladie de Crohn, rectocolite ulcéro-hémorragique), des pancréatites chroniques, des cancers des muqueuses buccales. Les enfants allaités par une mère non sécréteur présentent un risque plus élevé de présenter des allergies.

A noter :

Tous les patients avec polymorphisme ne présentent pas de symptômes, et tous les patients symptomatiques n’ont pas ce polymorphisme.

Certains laboratoires indiquent « secréteur » ou « non‑secréteur » directement, d’autres donnent le génotype GG/GA/AA.

Le gène seul ne suffit pas. Scientifiquement, il existe des associations de ce polymorphisme avec les troubles et pathologies énoncées. Cependant, les effets peuvent être modestes, multifactoriels et souvent inconsistants. L’erreur fréquente est de penser que modifier le microbiote suffit sans corriger le terrain.

Où réaliser ces tests ?

Pour le test FUT2 : Vers un laboratoire spécialisé, par exemple LIMS ou tout autre laboratoire d’analyses spécialisées (Barbier, Synlab France, Synlab Belgique, Eurofins, Kantysbio…). 

Notez bien le thérapeute qui vous suit lors de sa réalisation, afin qu’il reçoive sa partie spécifique et puisse vous expliquer votre prise en charge, surtout s’il ne connait pas ce test !

Télécharger le fichier d’analyses et le consentement en vue d’un test génétique ici : LIMS – Demande d’analyses fonctionnelles et consentement pour test génétique

(Extrait du laboratoire LIMS-MBNEXT)

Pour le test Shotgun : En cliquant ici

Prise en charge :

Le statut non sécréteur (homozygote variant FUT2 inactif) est de nature génétique. Mais le gène seul ne suffit pas.

➡️ Dans certains cas, pour réduire les risques associés à cette situation, il faut suppléer la déficience en donnant les glycans fucosylés que vous ne savez secréter. Certains laboratoires proposent des compléments du glycans fucosylés à prendre de manière continue ou par cure. Il est recommandé de commencer une supplémentation de 1g de ces glycans fucosylés matin et soir et puis de doubler cette dose en fonction de la réponse clinique.

Vous voulez en savoir plus sur votre profil ?

Le gène FUT2 influence directement la composition de votre microbiote intestinal. Les non-sécréteurs ont naturellement une diversité bactérienne différente et sont plus sensibles à certains déséquilibre.

➡️  Explorez votre flore avec INTEST.pro (Test Shotgun) : L’analyse de microbiote pour vous donner une vision complète de votre écosystème et son impact sur votre corps.

➡️ SIBO, Candidose, Test du Bicarbonate… Effectuez les autres tests et questionnaires en accès libre pour identifier plus précisément vos troubles digestifs.

Pour votre autonomie, il est important de bien faire les choses au départ en faisant appel à un micronutritionniste expérimenté.

Votre corps mérite le meilleur

Sonia Nutrition